La prueba consiste en calcular la similitud de los marcadores genéticos entre el ADN fetal, el ADN del presunto padre y el ADN de un número de hombres sin lazos de parentesco con el presunto padre, escogidos al azar. Cuando el presunto padre comparado con otros hombres escogidos al azar, tiene los marcadores genéticos exigidos para ser considerado como el padre biológico, la probabilidad obtenida es superior al 99,9% y el resultado obtenido es de “Inclusión de la Paternidad”. Si de lo contrario, las similitudes se encuentran en la gama de los individuos escogidos al azar, el resultado es de “Exclusión de la Paternidad“.

Es importante tener en  cuenta, que debido a las similitudes genéticas entre los miembros de una misma familia, si los presuntos padres provienen de la misma familia, es necesario analizar la muestra de todos los presuntos padres. Regla que se aplica igualmente en casos de parentesco lejano. Por otra parte, es también obligatorio someter a la prueba a todos los presuntos padres, en caso de que estos últimos formen parte de una pequeña población o de un mismo grupo étnico reducido. En tales casos, el ADN de todos los padres potenciales debe ser analizado, sin el análisis genético del segundo presunto padre, los resultados podrían dar una incorrecta inclusión de la paternidad.

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