El inconveniente si utiliza una muestra de sangre para saber el sexo del bebé es si la madre ha tenido recientemente un trasplante de médula ósea o una transfusión de sangre. En tal caso no podrá someterse a este test mediante una muestra de sangre (pero sí mediante una muestra de orina). Esto se debe a que en este test nuestros científicos se basan en la detección del cromosómica Y, y si la madre ha tenido recientemente una transfusión de sangre los resultados podrían dar falsos positivos (en otras palabras, el resultado podría confirmar erróneamente la presencia del cromosoma Y y, por tanto, concluir que usted está esperando un varón)
Si ha tenido un aborto involuntario o ha tenido un embarazo recientemente (3 meses), tampoco podrá someterse a este test mediante una muestra de sangre (pero sí mediante una muestra de orina), ya que es posible que todavía fluya por su sangre ADN del anterior bebé y por tanto los resultados no serían correctos.
La extracción de la muestra de sangre tampoco puede realizarse en personas que padecen hemofilia.